甘氨酸精氨酸二肽的结构计算和二肽气相最低能构象模型

摘要

研究了气相下的甘氨酸精氨酸二肽体系．在考虑三种异构体内轴转动时对势能面进行了系统采样．大量的初始构型经PM3、HF／3—21G＊、BHandHTJYP／6—31G＊及BHandHLYP／6—311＋＋G＊＊方法逐级优化获取了最终的稳定构型，低能的结构进一步运用BHandHLYP、cam—B3LYP、B97D及MP2方法在6—311＋＋G（3df，3pd）基组下进行了单点能计算．计算了重要构象的转动常量、偶极矩、垂直电离能、温度分布及红外光谱．最终数据表明，气相GlyArg主要以电中性的状态存在，参考所有的氨基酸及部分二肽的稳定结构特征，结合各类氨基酸的疏水性，归纳出了各种不同二肽的最低能构象是中性或双电性构型的理论模型．