首页> 中文期刊> 《生物医学工程研究》 >基于结构信息的RNA多序列比对

基于结构信息的RNA多序列比对

开具论文收录证明 >>

期刊封面封底目录下载 >>

文献代查 >>

页面导航

摘要
著录项
相似文献
相关主题

摘要

本研究提出了一种考虑了结构信息的同源RNA多序列比对算法,它先利用热力学方法计算出每条序列的配对概率矩阵,得到结构信息,由此构造各条序列的结构信息矢量,结合传统序列比对方法,提出优化目标函数,采用动态规划算法和渐进比对得到最后的多序列比对.试验证实了该方法的有效性.

著录项

来源
《生物医学工程研究》 |2009年第1期|1-5|共5页
作者
赵英杰; 王正志;
展开▼
作者单位

国防科技大学机电工程与自动化学院,长沙,410073;

国防科技大学机电工程与自动化学院,长沙,410073;

展开▼
原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类生物医学工程;
关键词
多序列比对; RNA二级结构; 配对概率矩阵; 结构信息矢量; 动态规划;

相似文献

中文文献
外文文献
专利

1. 基于序列结构信息的多序列比对算法 [J] . 张永 ,李其申 ,江泽涛 . 微计算机信息 . 2007,第021期
2. 一种新的基于结构信息的双生物序列比对方法 [J] . 司秀华 ,陈国良 . 小型微型计算机系统 . 2006,第001期
3. 一种新的基于两序列比对的ncRNA基因识别模型 [J] . 管乃洋 ,骆志刚 ,严繁妹 . 生物信息学 . 2007,第003期
4. 3种家禽线粒体基因组16S rRNA与tRNA-Leu基因序列比对分析 [J] . 李桢 ,王宝维 ,刘锦梅 . 青岛农业大学学报（自然科学版） . 2005,第004期
5. 基于Progressive多序列比对方法的求解多序列比对的启发式算法 [J] . 张津 ,郭茂祖 ,王亚东 . 生物信息学 . 2005,第004期
6. 多序列比对CLUSTAL W中两序列比对的并行 [C] . 尹智刚 ,王希诚 ,谷俊锋 . 第16届全国计算机新科技与教育研讨会 . 2005
7. 基于序列结构信息的多序列比对算法研究 [A] . 张永 . 2007

获取原文

客服邮箱：kefu@zhangqiaokeyan.com

京公网安备：11010802029741号 ICP备案号：京ICP备15016152号-6 六维联合信息科技 (北京) 有限公司©版权所有

客服微信
服务号