人类白细胞抗原新等位基因A*24∶257序列及其编码蛋白分子三维结构模拟分析

摘要

目的鉴定分析人类白细胞抗原（human leukocyte antigen,HLA）新等位基因A*24∶257的序列变异及其氨基酸残基改变在其编码蛋白分子三维空间结构中的位置及影响。方法应用PCR-SBT测序分型技术发现1例等位基因结果异常样本,采用单等位基因特异性测序进行鉴定。应用Phyre2蛋白折叠识别在线建模服务器以及RasMol和PDB Protein Workshop分析软件,对其编码蛋白分子三级结构及其氨基酸残基改变特点在MHC分子三维空间结构中所处位置及可能影响进行模拟分析。结果样本A*24∶198等位基因第2外显子第155位核苷酸碱基发生了T-＆A碱基替代。导致相应的第28位密码子由GTG→GAG。其编码氨基酸由缬氨酸（Val,V）变为谷氨酸（Glu,E）。与A*24∶02∶01相比,A*24∶257第28位编码氨基酸由中性缬氨酸（V）→酸性谷氨酸（E）,第29位由酸性天冬氨酸（D） →中性天冬酰胺（N）。其编码蛋白分子三级结构建模分析表明,该氨基酸变异位置位于α1结构域β折叠片层底面的外侧第3 β股链近转角处,接近抗原多肽结合槽中心外缘区域。结论该等位基因序列被WHO HLA因子命名委员会正式命名A*24∶257。分析预测其编码氨基酸改变将可能影响A*02:257分子的抗原多肽结合及呈递功能。