嗜酸氧化亚铁硫杆菌亚铁氧化酶基因分子多态性研究

摘要

嗜酸氧化亚铁硫杆菌(Acidithiobacillus ferrooxidans,A.f)属于化能自养、革兰氏阴性细菌,好氧嗜酸,以氧化亚铁离子或还原态硫化物(S0&S2-)获得能量生长.在其Fe2+氧化系统中,亚铁氧化酶起重要作用.对不同硫化矿区分离得到的5株A.f进行生长动力学和对亚铁氧化活性的对比研究,结果显示不同菌株之间存在表型差异.提取A.f菌株的基因组DNA,设计引物,对亚铁氧化酶基因进行PCR扩增,同时对扩增产物直接进行测序,并同GenBank的参考序列进行比对分析,发现序列相似性在99%～97%之间,分析编码区域发现在第187～195位可能存在一个高变异区:在第187～189位,菌株YTW编码的氨基酸Thr→Pro ;而在第193～195位,菌株TK是Met→Asn;菌株BY则是Met→Ile.另外在位点第219位,所有菌株都是T→C,但编码的氨基酸未发生变化,属于同义密码子.对于编码区上游序列,比对后没有差异;而对于编码区下游序列,经比对发现存在一些差异位点.