基于DNA序列K-tuple分布的一种非序列比对分析

摘要

文章在基因组K-tuple分布的基础上, 给出了一种推测生物序列差异大小的非序列比对方法.该方法可用于衡量真实DNA序列和随机重排序列在K-tuple分布上的差异.将此方法用于构建含有26种胎盘哺乳动物线粒体全基因组的系统树时, 随着K的增大, 系统树的分类效果与生物学一致公认的结果愈加匹配.结果表明, 用此方法构建的系统进化树比用其他非序列比对分析方法构建的更加合理.