狗枣猕猴桃锌指蛋白(AkZFP2)的生物信息学分析

摘要

为研究狗枣猕猴桃锌指蛋白(AkZFP2)功能提供参考,利用生物信息学工具和方法,对其蛋白质的理化性质、亲水/疏水性、跨膜结构、结构功能域、二级结构、三级结构、蛋白质修饰位点及同源性等进行分析和预测。结果表明:AkZFP2的cDNA全长为854bp,编码区(CDS)为435bp,由145个氨基酸组成的亲水性非稳定蛋白,属于ZF-C2H2-6蛋白家族(PFAM13912),主要构件为α-螺旋和不规则卷曲,包含1个植物特有的QALGGH序列锌指C2H2型结构域;与其他16种植物的ZFP氨基酸序列进行对比,狗枣猕猴桃与中华猕猴桃原变种亲缘关系较近。