印度血桐与中平树基因组调查及SSR分子标记分析

摘要

印度血桐与中平树是大戟科血桐属植物,该属植物具有多种药用价值,被广泛应用于民间医学中许多疾病的治疗,这两种植物种子中含有的神经酸也引起了研究者的高度关注.为确定适合印度血桐与中平树的全基因组测序研究策略,该研究采用二代高通量测序技术,结合生物信息学的方法首次测定了印度血桐与中平树的基因组大小、杂合率、重复率等基因组信息并初步分析了两种材料的SSR序列特征.结果表明:(1)印度血桐与中平树的基因组大小分别为986.84和946.23 M.(2)印度血桐与中平树的杂合率分别为0.75％和0.65％,重复序列比例分别为73.02％和71.5％.(3)通过对2种材料基因组序列的SSR特征分析,在印度血桐中共鉴定了4499185个SSR,在中平树中共鉴定了4969098个SSR.该研究结果为印度血桐与中平树SSR分子标记的筛选、开发以及全基因组深度测序提供了理论指导.