基于R软件包(Polysat)的巴山木竹多倍体植物微卫星数据处理

摘要

针对目前多倍体植物的微卫星数据等位基因拷贝数据处理困难、数据格式转换等问题,利用R语言下Polysat软件包,以巴山木竹13个种群260份样本的微卫星数据为例,进行微卫星数据的导入、输出和基因分析,如微卫星等位基因信息统计SSR数据的基因型判断及无性系克隆的划分,种群间的PCA分析,种群间的Fst值分析等。认为与其它多倍体数据处理软件相比,该软件R编程环境具备的多功能性和数据输入、输出方法简单等特性,为相关研究人员提供了方便。