基于网络药理学和分子对接分析连朴饮治疗新型冠状病毒肺炎伴胃肠道症状的作用机制

摘要

目的:基于网络药理学和分子对接探讨连朴饮治疗新型冠状病毒肺炎(corona virus disease 2019,COVID-19)伴胃肠道症状的作用机制和作用靶点。方法:运用中药系统药理数据库和分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology,TCMSP)检索连朴饮的有效成分及作用靶点,通过GeneCards、OMIM、TTD、PharmGkb、DrugBank数据库收集疾病相关靶点。借助String数据库和Cytoscape软件构建蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,并使用Cytoscape对网络进行拓扑分析,获取核心靶点,通过R语言进行基因本体(gene ontology,GO)功能富集分析、京都基因和基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析,最终将核心基因与主要活性成分进行分子对接验证。结果:本研究预测连朴饮所含中药的有效成分43个,对应靶点197个;拓扑分析得到转录活化蛋白1、白细胞介素-8、环氧合酶2、低氧诱导因子-1等12个核心靶点。KEGG通路富集分析筛选得到连朴饮治疗COVID-19合胃肠道症状154条通路,主要包含脂质和动脉粥样硬化、白细胞介素-17信号通路、糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、肿瘤坏死因子信号通路、流体剪切应力与动脉粥样硬化等通路,集中抗炎、抗病毒、调节免疫。分子对接结果表明,活性成分能分别与核心靶点结合,具有较好的亲和力。结论:连朴饮可能通过槲皮素、山柰酚等活性成分作用于STAT1、CXCL8、PTGS2、HIF1A等关键靶点,并通过调节AGE-RAGE信号通路、肿瘤坏死因子信号通路、白细胞介素-17信号通路等相关通路调控体内炎症水平,起到治疗COVID-19治疗胃肠道症状的作用。