不同牦牛毛色转录组特征以及候选基因筛选

摘要

为了解析不同牦牛毛色遗传的分子机制,选取环青海湖相同发育阶段的成年健康黑、白、棕色牦牛各3头为研究对象,采用Illumina Hi Seq TM2500测序平台对牦牛的皮肤组织进行转录组测序,所得序列经过数据质量控制、组装后与参考基因组进行比对,并对差异表达基因进行筛选和功能注释以及富集分析。结果显示:白色牦牛与黑色牦牛皮肤组织差异表达基因有426个,其中与毛色相关的基因有19个;白色牦牛与棕色牦牛皮肤组织差异表达基因有246个,其中与毛色相关的基因有16个,此两组差异表达基因在酪氨酸代谢通路上均有富集。黑色牦牛与棕色牦牛皮肤组织差异表达基因有4230个,其中与毛色相关的基因有138个。白色与棕色毛色的形成具有不同的调控机制,SOX10基因在棕色毛色形成中起到关键作用,酪氨酸代谢通路的抑制是白色毛色形成的关键因素。本研究从转录组水平对牦牛毛色差异表达基因进行分析,为进一步筛选牦牛毛色调控主效基因提供研究基础。