沃柑果皮响应柑橘锈螨危害的转录组分析

摘要

【目的】揭示柑橘抗柑橘锈螨危害的分子机制,筛选出在柑橘锈螨危害条件下的相关应答基因。【方法】研究以接种柑橘锈螨后危害3、5、7、9 d的沃柑果实为试材,健康果实为对照(CK),采用Novaseq6000平台进行转录组双向测序,并对数据进行生物信息学相关性分析。【结果】共获得了55.63 Gb cleanbases,去除低质量碱基和接头序列后,CK3、CK5、CK7和CK9获得Clean reads分别是42115939、45501683、58118008和40715511条,WG3d、WG5d、WG7d和WG9d获得Clean reads分别是46807089、49185798、44437798和44035730条。柑橘锈螨危害3、5、7、9 d后引起上调差异表达基因数量分别为2764、1812、3217、2778个,下调差异表达基因数量分别为3036、1387、3350、2347个。GO功能富集分析结果显示,差异表达基因在不同的柑橘锈螨危害时间段,主要集中在生物学过程、细胞组分和分子功能中。KEGG注释分析结果显示,差异表达基因主要参与二苯乙烯、二芳基庚烷和姜辣素的生物合成、核糖体、磷酸戊糖、光合作用、碳代谢等途径。【结论】植物激素信号转导、植物病原互作通路、类黄酮生物合成、苯丙氨酸代谢、戊糖磷酸代谢5条通路在沃柑响应柑橘锈螨胁迫过程中起到了重要的调控作用。