常见消化系统肿瘤CD177及相关基因表达与意义的生物信息学分析

摘要

目的探讨嗜中性粒细胞抗原CD177在常见消化系统恶性肿瘤(食管癌、结肠癌和胰腺癌)中的表达情况与患者预后的关系,并分析与其相关的基因和细胞通路。方法自公共数据库Gene Expression Omnibus(GEO)及The Cancer Genome Atlas(TCGA)中提取相应癌症数据集,以获取患者信息及mRNA表达数据,借助R2生物信息分析平台,以Kaplan-Meier法绘制生存曲线,分析CD177表达情况与患者预后的关系,筛选出与CD177表达显著相关的基因并进行Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)通路分析。结果在3种癌症数据集中(食管癌75例,结肠癌174例,胰腺癌132例),CD177的mRNA高表达患者的总体生存率均低于低表达患者(P=0.050,P=0.045,P=0.018)。此外,与CD177表达相关的基因在3个数据集中分别有11 927、4 100和7 493个。KEGG通路分析发现,CD177高表达时除正常消化功能的信号通路被激活外,还涉及多种炎性反应机制相关的信号通路。结论 CD177的表达水平与食管癌、结肠癌和胰腺癌患者的总体生存率相关,可能成为研究患者预后的潜在分子标志物。