水稻籼粳亚种间rDNA的ITS(internal transcribed spacer,ITS)序列分析

摘要

为探讨水稻亚种间的遗传背景及亲缘关系 ,运用PCR技术扩增并测序了水稻籼亚种的南京 11号、9311、广陆矮 4号三个品种和粳亚种的秋光、日本晴、爪哇稻三个品种的完整ITS区 (包括 5 .8S区 )。供试材料的 5 .8SrDNA的长度和G C含量完全一致。ITS1的长度为 193- 195bp ,G C含量为 72 .31% - 74 .38;ITS2的长度为 2 2 4 - 2 32bp ,G C含量为 74 .4 6 % - 76 .86 %。序列的相似性为 94 .4 % - 99.3%。CLUSTAL .W软件排序及分析表明 :1)存在 4个信息位点把 6个品种分为籼粳两大类群 ;2 )籼稻之间的ITS序列的同源性小于粳稻之间的同源性。由此可见 ,水稻核糖体DNA的ITS序列的变化规律与其传统的分类具有高度的一致性。