基于线粒体RNAs序列分析雁形目家禽的分歧时间

摘要

雁形目鸟类具有重要的社会经济意义和科学研究价值,部分种类已被驯化成为重要的家禽,然而雁形目内部物种之间的关系仍存在许多争议。由于线粒体基因组具有独特的遗传特点,因此选用线粒体RNAs序列标定雁形目部分鸟类的分歧时间,旨在进一步查明该类群系统进化关系。首先,采用酚仿法分别从太湖鹅和朗徳鹅血液中提取基因组DNA,PCR扩增获得线粒体RNAs基因序列。然后,从GenBank中提取10种鸟类线粒体DNA的同源序列,以鸵鸟为外群,采用贝叶斯法结合RNA结构信息重建系统发生关系;最后,以黑雁属与雁属的分歧时间为锚定点,利用r8s软件分析了雁形目物种间的分歧时间。结果表明,中国鹅与欧洲鹅的分歧时间为0.61百万年,番鸭与家鸭的分歧时间为15.5百万年。依据家鹅祖先分歧时间,联系当时发生的地学事件,推测家鹅祖先物种分化与更新世冰川运动有关。研究结果有助于中国水禽遗传资源的保护与利用。