TMGMV完整基因组的统计特征

摘要

提取TMGMV完整基因组的统计特征,并对它进行聚类分析。在TMGMV完整基因组的碱基序列上,用每个碱基及其随后二个碱基所构成的三碱基组,排列成一个新的序列S;计算所有64种不同三碱基组在S上出现的概率,得到一个64维向量L;比较各个基因组的L向量,得到6个三碱基组,它们的概率有明显地差异。6个三碱基组(AAG;AGA;TGA;GAC;GAG;GTT)的出现概率与TMGMV基因组的遗传变异有着重要关联;4个不同来源的TMGMV完整基因组,按其遗传变异结果,形成2个大类。