烟草花叶病毒及其弱毒株基因组的cDNA克隆和序列分析

摘要

利用RT PCR技术获得了覆盖整个烟草花叶病毒 (Tobaccomosaicvirus,TMV)强毒株TMV W、2个弱毒株TMV 0 17和TMV 15 2基因组 (RNA)的cDNA克隆。序列测定结果表明 ,强、弱毒株全长均为 6 395个核苷酸 ,具有 4个开放阅读框 (openreadingframe,ORF) ,分别编码 12 6、183、30、17.6kDa蛋白。TMV W和普通株系TMV U1的基因组同源率达到 98% ,TMV W为普通株系。TMV 0 17、TMV 15 2基因组发生变异的部位主要在 12 6 /183kDaORF中。和TMV W相比 ,TMV 0 17仅在 12 6kDa蛋白ORF中有 18个碱基发生变异 ,其中 10个碱基引起氨基酸的改变 ;而TMV 15 2在 183kDaORF中有 16个碱基发生变异 ,其中有 11个引起氨基酸的改变。TMV 0 17和TMV 15 2有 11个共同变异的碱基 ,其中有 8个引起氨基酸的变异。TMV 15 2在 30kDaORF中有 1个碱基发生变异而引起氨基酸的改变。其它区域 ,三者完全相同。