利用ITS序列探讨谷精草属5个种的系统发育

摘要

以谷精草属（Eriocaulon）的尼泊尔谷精草（Eriocaulon nepalense）、白药谷精草（E.cinereum）、高山谷精草（E.alperstre）、华南谷精草（E.sexangulare）、南亚谷精草（E.oryzetorum）等5个种为研究对象,通过PCR扩增技术获得了谷精草属5个种的内转录间隔区序列,并对ITS序列进行分析.结果发现,供试谷精草属植物的ITS区长度并不完全一致,其ITS1的长度范围为171～306 bp,G＋C含量为38.24%～55.04%;ITS2的长度范围为184～288 bp,G＋C含量为36.46%～57.02%.在此基础上,采用Clustal W version 1.7对所得的ITS序列进行排序与分析,以灯心草属（Juncus）的一个种J.dregeanus为外类群,并使用PAUP 4.0 10 b软件采用最大简约法分析获得最简约的系统发育树。结果表明,在检测的ITS序列的738个位点中稳定位点174个、变异位点564个（包括276个信息位点）。另外,从发育树上平行分出两个大的总分支,其中E.nepalense、E.oryzetorum、E.alpestre和E.cinereum（云南宣威）为一支;E.sexangulare为一支。上述二个分支与外类群聚在一起,bootstrap值为100%。