新疆乌鲁木齐HIV-1流行毒株膜蛋白基因C2-V3区序列测定和亚型分析

摘要

应用ＰＣＲ方法对７份１９９６年３－５月采集于新疆乌鲁木齐ＨＩＶ－１阳性静脉吸毒者的外周血单核细胞（ＰＢＭＣｓ）样品进行扩增，获得了ＨＩＶ－１膜蛋白（ｅｎｖ）基因的核酸片段，并对其Ｃ２－Ｖ３区及邻区３５０－４５０个核苷酸序列进行了测定和分析。研究结果表明，７份样品都为Ｃ亚型的ＨＩＶ－１毒株序列，其组内的基因离散率为１．０％；与Ａ－Ｅ参考亚型及部分Ｃ亚型代表株序列相比较，这７个毒株与代表印度Ｃ亚型毒株及云南德宏州Ｃ亚型毒株的序列十分相似，其组间的基因离散率均为３．５％，与非洲Ｃ亚型毒株ｎｏｆ的基因离散率为１４．０％。根据以上数据及其它资料提示，ＨＩＶ－１在新疆乌鲁木齐的流行时间不长，且其毒株的传入与流行在云南德宏州的相同亚型ＨＩＶ－１毒株密切相关。