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《南宁师范大学学报(自然科学版)》由南宁师范大学主管、主办,其出版全流程由学校设立的学报编辑部负责。纸质出版后单篇分类网络传播由:《中国学术期刊(光盘版)》电子杂志社、万方数据股份有限公司、北京世纪超星信息技术发展有限公司域出版合作中心、重庆维普资讯有限公司等以数据库形式再版。