木薯两性花全基因组DNA甲基化差异分析

摘要

为探究木薯两性花和正常花基因组DNA的甲基化模式以及甲基化水平差异,并找到木薯两性花与正常花之间的差异甲基化基因,本实验采用全基因组甲基化测序技术(WGBS)对木薯两性花(WLa)和正常花(CKa)的基因组DNA甲基化水平进行分析比较。结果表明,木薯花内的DNA甲基化模式主要有mCG、mCHG、mCHH三种类型,CG位点的平均甲基化水平最高。WLa处于全甲基化状态(ML100)的mCG和mCHG均多于CKa,而mCHH则略低于CK。对木薯两性花和正常花进行差异甲基化(DMR)鉴定研究,共检测到14987个DMR和5697个DMGs。另外,基因本体(GO)分析显示,基因高度富集在催化活性、结合、代谢等过程中。相关信号通路(KEGG)分析则表明。基因主要富集到赖氨酸生物合成、ABC转运蛋白体等代谢通路中。