玉米CKX基因家族生物信息学及表达模式分析

摘要

细胞分裂素氧化酶/脱氢酶(cytokinin oxidase/dehydrogenase,CKX)通过降解细胞分裂素,调控植物体内细胞分裂素平衡,进而调控植物的生长发育。本研究对玉米基因组中CKX基因(ZmCKX)家族成员进行了鉴定分析,并基于转录组数据分析了ZmCKX基因在正常条件和胁迫条件下多个组织中的表达情况。结果表明:在玉米基因组中鉴定出13个可分为5个亚组的CKX基因家族成员,分布在7条染色体上,CDS长度在1.5~1.7 kb,氨基酸长度在519~582 aa,理论等电点在5.5~8.5,存在4处串联重复;ZmCKX4b基因进化时间最早,ZmCKX9基因进化时间最晚;转录组数据分析表明:13个ZmCKX基因的表达模式存在明显的差异,其中ZmCKX10基因在所有时间点的各个组织中都有比较高的表达量,ZmCKX7~ZmCKX93个基因的表达具有组织特异性。ZmCKX基因在籽粒发育过程和胁迫条件下,呈现多种表达模式。本研究可为深入研究玉米CKX基因家族生物学功能提供一定的理论基础。