萨福克和湖羊杂交F1代与湖羊背最长肌转录组分析

摘要

试验比较分析萨福克与湖羊杂交F1代和湖羊纯繁羔羊背最长肌差异表达基因转录组，探索影响萨湖F1代和湖羊肉质的重要基因和关键代谢通路。采集10月龄萨福克与湖羊杂交F1代羔羊（SH）和湖羊纯繁羔羊（HH）背最长肌组织，利用RNA-seq技术进行基因转录组比较分析，差异表达基因qRT-PCR验证。结果显示：筛选出差异基因322个，得到GO数据库注释278个，参与生物过程（BP）、分子功能（MF）和细胞组成（CC）的分别为83、140和55个。得到KEGG数据库注释147个，参与216条通路，差异基因显著富集通路24条。通过查阅文献和对比分析，初步认为与肉质相关的通路为氨基酸的生物合成通路、甘油酯代谢通路、PPAR信号通路、MAPK信号通路和肌动蛋白细胞骨架的调节通路。筛选出与肉质相关的候选基因有LPIN1、CFL2、ENO3和AQP7。研究表明，在转录组水平上筛选出萨福克与湖羊杂交F1代、湖羊纯繁羔羊背最长肌差异表达基因322个，初步认为与肉质可能相关的通路11条，与肉质相关的候选基因4个。