9种市售益生菌制剂规范性的宏基因组分析

摘要

为了从分子生物学角度解析市售益生菌制剂的规范性、科学性，以便为我国畜牧业生态养殖中系统性使用益生菌制剂提供技术参考，试验采用高通量测序技术分别对9种市售益生菌制剂（编号为ME-1～9）16S rDNA的V3、V4区与18S rDNA的V7、V8区进行测序，宏基因组分析不同产品的α多样性及菌群结构，比较不同产品的微生物组成及丰度。结果表明：ME-6的原核生物α多样性指数中平均ACE、Chao1、Shannon、Simpson指数分别为48.350,46.7,3.128,0.803,在所有产品中相对较高，所含原核微生物种类较丰富，且多样性高；ME-9的真核生物α多样性指数中平均ACE、Chao1、Shannon、Simpson指数分别为75.266,71.2,3.009,0.745,在所有产品中指数相对较高，所含真核微生物种类较丰富且多样性高。ME-1、ME-2、ME-3、ME-6、ME-7中芽孢杆菌属的丰富度在60%以上，其余制剂中也均被检出，但只有ME-1、ME-2、ME-3标示中显示有芽孢杆菌；ME-6、ME-7标示中显示的原核生物只有乳杆菌属，而实际检测到乳杆菌属的丰度分别仅为0.07%、0.04%;制剂标示的菌种类型、含量与实际所测结果存在较大偏差。所有制剂中丰度较高的真菌属分别是未分类的酵母菌科、未分类的曲霉菌科、毕赤酵母属等；ME-7、ME-9未标示任何真菌，但实际测得真菌种类高达20种以上，与标示严重不符。ME-1、ME-2、ME-3、ME-4、ME-5、ME-7中均检测出埃希氏菌属-志贺氏菌属，含量在0.01%～1.94%之间，其余制剂也检测出不同含量的条件致病菌，如沙门氏菌属、摩根菌属、变形杆菌属等。说明试验检测的市售益生菌制剂存在标示不完整、所含菌种杂乱、质控不严等诸多问题，可能不仅未起到益生作用反而带来潜在的疫病传播风险。