猪圆环病毒2型贵州株全基因组的克隆与序列分析

摘要

应用PCR方法对采自贵州长顺、清镇和仁怀地区疑似断奶仔猪多系统衰竭综合征的病料进行了猪圆环病毒2型（PCV2）全基因组扩增、克隆和测序分析.结果表明：所扩增克隆的3株PCV2中,GZ-QZl （JQ809463）和GZ-RHl （JQ809464）2个PCV2毒株基因组全长为1 767 bp,GZ-CSl （JQ809462）株为l 768 bp;3株PCV2之间的核苷酸序列相似性介于94.5％ ～99.9％,与国内外参考毒株核苷酸序列相似性为93.6％ ～99.9％;全基因组序列比对分析表明,GZ-QZ1和GZ-RH1两个毒株属于PCV2b,GZ-CS1株属于PCV2a.对3株病毒编码Cap蛋白的ORF2基因分析发现,GZ-QZ1和GZ-RH1毒株与GZ-CS1毒株相比在696位缺失了一个碱基A,导致移码突变,使得末端氨基酸序列变由L（K）P变为L（N）PR.