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‘鄞红’葡萄PP2C基因的克隆与生物信息学分析

         

摘要

PP2C是一类重要的蛋白磷酸酶,广泛参与各种逆境胁迫响应。为了了解PP2C基因在植物体内发挥的特殊功能,以‘鄞红’葡萄为材料,利用RT-PCR等技术克隆了全长,并对该基因进行生物信息学分析。结果显示,PP2C基因全长为1522 bp,其中开放阅读框(ORF)长度为1512 bp,编码506个氨基酸。通过多种软件比对分析,‘鄞红’葡萄与柑橘(Citrus sinensis)、樱桃李(Prunus avium)、草莓(Fragaria vesca)、黄瓜(Cucumis melo)的相似性高达95%以上,亲缘关系较近。该结果为进一步研究‘鄞红’葡萄PP2C蛋白功能以及揭示该蛋白在植物响应非生物胁迫过程中发挥的作用提供了一定基础。

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