蝴蝶兰MYB家族基因鉴定及应对病毒的表达响应

摘要

MYB转录因子是一类参与调控次生代谢和细胞形态、增强抗病性和应对生物和非生物胁迫反应的蛋白家族。本研究依据小兰屿蝴蝶兰(Phalaenopsis equestris)基因组和蝴蝶兰‘大辣椒’(Phalaenopsis‘Big Chili’)响应病毒胁迫转录组的测序结果,采用Pfam、HMMER、OrchidBase 3.0网站和Bioedit、MEGA 5.1、Jalview软件,对蝴蝶兰MYB家族基因进行了筛选和分类,分析了其基因类型、结构特点和系统进化关系,从小兰屿蝴蝶兰中筛选到152个MYB家族基因,其中R2/R3型6个、R2R3型138个、R1R2R3型3个。从大辣椒响应病毒胁迫转录组数据中共筛选得到55个MYB家族基因,其中有7个在响应不同时期差异表达明显,2个R2R3-MYB亚家族基因在感染病毒初期和携带病毒时期大幅上调,3个与小兰屿蝴蝶兰同源性较低。通过对小兰屿蝴蝶兰基因组和蝴蝶兰‘大辣椒’响应病毒胁迫时期MYB基因的筛选,为研究蝴蝶兰响应病毒关键MYB家族基因的分子功能提供了重要依据。