参薯GRAS基因家族的挖掘与特征分析

摘要

参薯属于薯蓣科薯蓣属,是热带地区重要的粮食作物,具有很高的营养价值。GRAS基因是一类重要转录因子,在植物的生长和发育中起关键作用。本研究从参薯基因组鉴定75个GRAS基因,通过多序列比对结果和系统进化树构建,将参薯GRAS家族蛋白划分为7亚家族,其中属于LISCL亚家族基因最多。分析Da GRAS保守motif发现,同一亚家族的GRAS蛋白具有更相似的motif结构、特征。根据参薯叶、块茎、零余子和花序组织转录谱数据分析GRAS基因的表达量,发现大比例基因表达量低,Da GRAS18、Da GRAS53等基因表达具有组织特异性。RT-qPCR实验表明DaGRAS9基因在块茎中高表达,其结果与转录谱数据一致,该基因的转录自激活实验表明该基因有转录活性。本研究对参薯Da GRAS家族进行初步分析,为以后Da GRAS家族的基因功能验证打下基础。