基于SSR标记的山西晋南漆树种群遗传结构

摘要

漆树(Toxicodendron vernicifluum (Stokes) F. A. Barkley)是中国重要的多年生落叶乔木,在生态群落保护和生物制药方面均有较高的利用价值,因此,具有重要的研究意义。本研究首先通过单因素试验确定了漆树SSR-PCR体系,进一步经正交试验对其SSR-PCR体系进行优化和筛选。通过PCR扩增筛选出7对条带清晰、多态性好的引物,7对引物最适退火温度分别是:57℃,55.6℃,58℃,57℃,56.8℃,56℃,58℃。基于建立的漆树SSR-PCR体系,利用选出的7对引物,对46个漆树样本进行遗传多样性及遗传结构分析,获得漆树种群内的观察等位基因平均数Na、有效等位基因数Ne、Shannon多样性指数I、Nei's基因多样性指数H分别为1.79、1.24、0.27、0.16,多态位点百分率PPB为88.72%,表明漆树种群内部具有丰富遗传多样性,AMOVA分子方差分析结果显示漆树种群内遗传变异74%高于种群间变异26%,表明种群内的遗传变异大于种群间。导致此种现象可能与漆树的传粉方式、种子特征和种子播撒机制以及环境抑制有一定的关系,本研究结果为合理开发利用漆树天然林,发掘其经济价值提供理论依据。