基于线粒体COI、NDI和12S rRNA基因序列的包虫病标本的分子分类学研究

摘要

目的克隆一例临床包虫病标本的线粒体基因COI、ND1和12S rRNA的基因序列,在基因水平上对包虫病病原体进行诊断,分析棘球绦虫线粒体基因序列差异。方法根据Gen Bank中登录的棘球绦虫线粒体基因COI、NDI和12S rRNA的序列信息分别设计3对引物,扩增临床包虫病标本的COI、NDI和12S rRNA基因,并进行测序。对所克隆的目的基因序列进行BLAST分析并与Gen Bank中已收录的部分棘球绦虫的COI、NDI和12S rRNA基因序列进行对比分析,并制做系统发生树。结果从包虫囊液DNA中成功克隆了长度分别为528 bp、1 001 bp和246 bp的基因片段,序列分析表明所克隆的基因片段为多房棘球绦虫的COI、NDI和12S rRNA基因。其中基因COI和NDI可以用于棘球绦虫的种间分类,而基因片段12S rRNA不能用于棘球绦虫的种间分类。结论从基因水平上确诊了此例包虫病患者的病原体为多房棘球蚴。