应用DGGE分析噬菌体对感染大肠杆菌雏鸡肠道菌群的影响

摘要

建立雏鸡大肠杆菌感染动物模型,应用PCR-DGGE技术对不同组别(对照组,大肠杆菌感染阳性组,噬菌体作用组)雏鸡的粪便菌群16S r DNA V6区段进行分离。结果显示,随着日龄的增长,雏鸡肠道菌群多样性逐渐增多。测序结果表明,肠球菌、大肠杆菌、葡萄球菌以及梭菌等均有出现;DGGE图谱显示大肠杆菌感染雏鸡后,雏鸡肠道菌群出现变化,图谱条带出现增加或缺失,噬菌体作用后有些条带于第1天或第3天逐步恢复正常,有些菌群不受大肠杆菌影响;聚类分析图显示噬菌体作用第二天后肠道菌群多样性开始恢复。本研究为探讨噬菌体治疗雏鸡大肠杆菌病的作用机制奠定了基础。