基于网络药理学和分子对接探究神术散治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的作用机制

摘要

基于网络药理学探究神术散治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的有效成分和分子机制,以及结合文献和TCMSP数据库搜集神术散活性成分和作用靶点,从GeneCards数据库搜寻COVID-19疾病靶点,利用Venn网站、String在线平台及Cytoscape 3.6.1软件分别构建神术散-COVID-19的交集靶点Venn图、交集靶点蛋白互作PPI网络和"药物-成分-靶点"网络图,再通过GO、KEGG富集分析预测作用机制。将神术散degree值排名前10种的活性成分与新冠肺炎病毒的潜在作用靶点血管紧张素转化酶Ⅱ(ACE2)、SARS-CoV-2 3CL水解酶(3CLpro)进行分子对接验证。神术散中共有58个活性成分及3 878个靶点,其中与疾病相关的共656个靶点。新冠肺炎相关的疾病靶点共438个,神术散与新冠肺炎交集靶点共81个,15个PPI核心网络关键靶点;712个节点,3 364条边的"药物-成分-靶点"网络图,60条GO功能分析关键条目,20条KEGG富集相关信号通路,分子对接显示神术散中主要成分紫檀素、木犀草素和柳穿鱼黄素与3CLpro及ACE2有很好的结合力。提示了神术散可能通过免疫调节、抗炎、抗病毒等途径起到干预COVID-19的作用。