云南传统水稻品种Waxy基因多样性形成和维持机制初探

摘要

本研究针对Waxy基因第四外显子和第五外显子的3个功能位点开发了新的AS-PCR标记,完善了Waxy基因的分子标记体系,为更精确的鉴定和筛选目标Waxy等位基因提供了工具。直链淀粉含量测定和AS-PCR分析结果显示,云南传统水稻品种具有极为丰富的Waxy基因多样性和直链淀粉含量变异,308个传统品种中共检测到65种不同的Waxy单倍型,直链淀粉含量变幅为0~48%。In1、E6、E10和E4op/hp这4个位点的碱基频率在四大稻区间存在显著差异,E2位点和In1位点的碱基频率在不同民族间存在显著差异,表明不同稻作区、不同民族对水稻直链淀粉含量和Waxy基因有着多样化的选择。同时民族混居地区E2和In1位点的碱基频率不同于其相应的民族独居地区,说明不同民族混居也会产生对Waxy基因不同的选择并增加Waxy基因的多样性。多样化的选择和民族混居是云南传统水稻品种Waxy基因多样性形成和维持的重要机制。在云南四大稻作区中,南部边缘水陆稻区的Waxy单倍型最为丰富,共检测到50种单倍型,占总数的77%,这一区域应被设为云南传统稻种资源的保护优先区和核心区。