2008年福州市肠道病毒71型毒株VP1基因的进化分析

摘要

目的：对FZ06008株、FZ17408株VP1进行基因特性分析。方法：采集福州市2008年6月手足口病人的标本,接种于RD细胞进行病毒分离,采用RT-PCR方法进行核酸鉴定,将VP1基因克隆和序列测定,并利用DNA-STAR软件对VP1基因进行遗传性分析。结果：与标准株B rCr相比,FZ06008和FZ17408的VP1编码区没有出现核苷酸的缺失和插入,氨基酸同源性约为94.6%,核苷酸同源性约为79.1%;与安徽省2008年流行株703813-Fuyang-08和我国深圳2003年流行的SHZH03株相比,氨基酸同源性约为99%-99.3%。结论：FZ06008株和FZ17408株有可能来源于2003年深圳地区EV71大规模流行时的毒株,其进化途径可能与安徽阜阳的标准株703813-Fuyang-08相近。