跨膜蛋白结构预测新方法

摘要

基因组数据中大约有20%～30%的基因产物被预测为膜蛋白,膜蛋白是一类具有重要生物功能的蛋白质.预测膜蛋白跨膜区的数量和位置是生物信息学中重要的研究课题.提出了一种预测膜蛋白跨膜区的新方法——连续小波变换极大值谱(MSCWT).该法对8种SARS-CoV膜蛋白的预测准确度与常用膜蛋白预测软件TMpred相当,对MPtopo数据库中131种新的已知结构的螺旋束蛋白(共包含548个跨膜区)的预测显示,其跨膜螺旋区预测准确率为91.6%,膜蛋白序列的预测准确率为89.3%.