辽宁省风疹野病毒基因特征分析

摘要

目的了解辽宁省现阶段流行的风疹野病毒基因特征,为风疹的控制和消除提供科学依据。方法用Vero/Slam细胞从2007-2008年采集的风疹暴发和散发患者标本中分离到22株风疹野病毒(Rubella Virus,RV),应用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)针对RV分离株的E 1基因739个核苷酸片段进行PCR扩增,再对扩增产物进行核苷酸序列测定,与世界卫生组织(WHO)RV基因型参考株进行分子流行病学比较分析。结果核苷酸和氨基酸同源性比对及构建亲缘关系树结果显示,22株RV分离株属1 E基因型,核苷酸和氨基酸同源性分别为97.6%～100.0%和99.1%～100.0%;与1 E基因型参考株序列的核苷酸和氨基酸同源性分别为97.0%～99.1%和99.1%～100.0%结论辽宁省分离的22株RV均为1 E基因型,并且可能是辽宁省现阶段的优势基因型。