基于比较蛋白质组学技术的牙髓卟啉单胞菌毒力因子分析

摘要

目的分析牙髓卟啉单胞菌（Porphyromonas endodontalis,Pe）和不同毒力牙龈卟啉单胞菌（Porphyromonas gingivalis,Pg）表达量相近的蛋白,筛选Pe潜在的毒力因子。方法将Pe ATCC35406分别与Pg高毒力株PgW83、低毒力株PgATCC33277进行全细胞蛋白质组学比较,采用相对和绝对定量同位素标记（isobaric tags for relative and absolute quantitation,iTRAQ）与纳升液相色谱串联质谱nano liquid chromatography-tandem mass spectrometry,Nano-LC-MS/MS)相结合的比较蛋白质组学技术,通过同位索标记肽段、质谱检测和生物信息学分析等方法,分析Pe ATCC35406分别与Pg W83、Pg ATCC33277之间表达相近的蛋白数及蛋白的生物学功能。结果 Pe ATCC35406和Pg W83比较时共鉴定到1 210个蛋白,其中表达量相近的蛋白130个（占蛋白总数的10.74%）,包括89个功能蛋白和41个未知功能蛋白;PeATCC35406和PgATCC33277比较时共鉴定到1 223个蛋白,其中表达量相近的蛋白110个（占蛋白总数的8.99%）,包括72个功能蛋白和38个未知功能蛋白。Pe ATCC35406与不同毒力的Pg表达相近的蛋白集中在外膜蛋白和蛋白酶,包括有致病作用的重组活化基因A（recombination activation geneA,RagA）、脂蛋白、伴侣蛋白Dnak、Clp家族蛋白（ClpC和ClpX）以及多种铁结合蛋白等,主要行使催化活性和结合功能,参与代谢和细胞进程。Pe ATCC35406与Pg W83表达相近的毒力蛋白种类和数目相对多于与低毒力PgATCC33277表达相近的蛋白。结论脂蛋白、氧气耐受蛋白、铁结合蛋白等可能为Pe ATCC35406潜在的毒力因子,Pe的致病能力与高毒力Pg更接近。