TT病毒的检测及部分核苷酸序列比较

摘要

目的 为阐明TT病毒(TTV)流行病学特征和基因组异质性以及为血清学诊断试剂的研制提供资料.方法 从健康查体者的血清中提取DNA,设计一套引物,采用套式聚合酶链反应(nested-PCR),检测TTV,对其中7例阳性标本进行了克隆测序,并与2株日本株TTV的核苷酸序列作了比较.结果 111例正常人中TTV的感染率为12.6%.7株中国株TTV间的核苷酸同源性为90.6%～95.4%,与日本株TX011(O)的核苷酸同源性93.0%～95.0%,而与日本株TA278同源性则在72.9%～74.7%之间.所推测的7株中国株TTV间氨基酸同源性为81.9%～99.4%,与日本株TX011(O)氨基酸同源性为85.5%～88.6%,而与日本株TA278氨基酸的同源性仅为68.1%～71.7%.结论 正常人群中TTV的携带率比较高.7株中国株TTV变异相对较小,同源性比较高,与日本株TX011(O)属于同一基因型.氨基酸的变异大于核苷酸变异.