SEN病毒D亚型中国株流行病学及序列变异

摘要

目的了解SEN病毒D亚型中国株的流行病学特点及其进化地位. 方法分析已知的基因序列设计引物,建立半套式PCR检测方法,对58份献血者血清样本和25份non-A～E肝炎患者血清样本进行了SENV-D亚型的检测,并对部分阳性血清的PCR产物进行克隆测序. 结果无偿献血者中SENV-D亚型感染率为45%,在non-A～E肝炎患者中SENV-D亚型感染率为48%,两者间差异无显著性;但在无偿献血者中SENV-D亚型的阳性检出率大大高于国外报道.测序结果经BLASTP软件在GenBank中检索表明,各测序株均与已知的SENV-D株序列有很高的同源性,并在此基础上用MegAlign软件进行进化树分析. 结论建立的半套式PCR检测方法适用于SEN病毒D亚型检测;SENV-D亚型中国株之间以及与已发表的国外SENV-D株序列之间有变异.与无偿献血者相比,non-A～E肝炎患者血清SENV-D株无进化上的显著倾向性.在测序的部分ORF1序列中存在一个核苷酸高变区.