利用基因芯片技术对一种未知病毒的筛查与鉴定

摘要

目的利用本研究室已建立的人类医学病毒属水平基因芯片筛查技术及主要虫媒病毒基因芯片检测技术,对2006年7月从山西临沂地区猪脑组织中分离到的未知病毒进行筛查与鉴定,确定其病原体。方法从猪脑组织中分离到病原体,接种金黄地鼠肾细胞（BHK21细胞）,能产生细胞病变（cytopathic effect,CPE）。收集病毒感染的细胞上清,提取 RNA,经逆转录及随机引物 PCR扩增后,与医学病毒属水平基因芯片进行杂交,初步确定其所在的病毒属之后,再与主要虫媒病毒基因检测芯片进行杂交,进一步将病毒鉴定到种。通过与其他鉴定结果相比较,确定其检测特异性。结果与医学病毒属水平基因芯片杂交结果显示,该病原体属于黄病毒属病毒。结合流行病学调查分析,该病毒可能是一种虫媒病毒,因此进一步与主要虫媒病毒基因芯片杂交,基本可以判断该病原体为乙型脑炎病毒,与本室 PCR 及基因序列测定结果一致。结论本研究室所建立的基因芯片筛查与鉴定技术可初步应用于对未知病毒的鉴定,为未知病毒性病原体的确定提供了一种新的技术方法。