婴幼儿血管瘤的microRNA-circRNA芯片分析

摘要

目的:筛选比较婴幼儿血管瘤(IH)组织与血管瘤临近正常皮肤组织中miRNA、circRNA的差异表达情况.方法:从GEO数据库获取IH组织的miRNA及circRNA芯片数据,使用GEO2R工具分别对其进行差异分析,筛选差异表达分子.使用RNAhybrid工具构建差异表达分子的miRNA-circRNA相互作用关系.通过KEGG数据库分析差异表达的miRNAs参与的信号通路.结果:差异分析共得到139个差异表达的miRNAs和1000个差异表达的circRNAs.RNAhybrid工具预测得到354条相互作用关系,共涉及81个DEMis和35个DECis.对DEMis的KEGG通路分析发现,有14个差异miRNAs参与了肺癌、食管癌、肝细胞癌、结肠癌、乳腺癌、上皮性卵巢癌、膀胱癌及前列腺癌的信号通路.结论:14个差异表达的miRNAs富集在癌症发生通路,可能参与IH的发生和发展.