2015年四川省麻疹病毒分子流行病学特征分析

摘要

目的分析四川省2015年流行的麻疹病毒的基因型别和核蛋白基因特征,了解不同基因型别麻疹病毒在省内流行情况。方法采集疑似麻疹病例咽拭子标本,用Vero/SLAM细胞分离病毒。对分离培养阳性毒株,采用逆转录-聚合酶链反应（RT-PCR）扩增核蛋白N基因片段并进行序列测定和分析。结果从971份疑似麻疹病例咽拭子标本中分离得到398株麻疹病毒。397株分离株为H1基因型,与H1基因型参考株核苷酸同源性为96.2%-98.0%;在进化树上呈现为2个分支,分支间平均核苷酸差异率为2.0%。1株分离株为A基因型,与A基因型参考株核苷酸同源性为98.0%。结论 H1基因型为2015年四川省本土流行麻疹病毒的优势基因型;近年来四川省内流行的毒株未发生较大变化,但存在一定核苷酸差异,呈现2个传播链,需进一步加强监测。