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青海省结核分枝杆菌临床分离株可变数目串联重复序列基因多态性研究

         

摘要

目的初步了解青海省结核分枝杆菌临床分离株基因多态性和基因分型特征。方法 2009-2012年收集青海省疾病预防控制中心分离的结核分枝杆菌临床分离株, 提取DNA, 对15个可变数目串联重复序列(VNTR)位点进行PCR扩增和产物电泳分析, 使用BioNumerics软件对菌株进行聚类分析。结果共检测251株结核分枝杆菌临床分离株的15个VNTR位点, 显示这些菌株有明显的基因多态性, 15个VNTR位点中Hunter-Gaston指数&0.6的VNTR位点有6个, 位点分辨能力最高的是MIRU26, 经聚类分析, 可分为4个基因群, 238个基因型。4个基因群分别占4.9%、91.9%、1.6%和1.6%。结论青海省流行的结核分枝杆菌菌株存在明显的VNTR基因多态性。

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