Dehouck-Gilis-Rooman统计势能函数的简化

摘要

统计有效能函数(Statistical effective energy function (SEEF))又称统计势能函数,来源于对已知蛋白质结构数据库进行的统计分析.近年来Dehouck-Gilis-Rooman (DGR)小组通过将蛋白质结构的总体统计势能分解成低阶的势能项之和,提出了一种新型的统计势能函数,这种势能函数由有限个可加和的项组成.我们试图对这种势能函数进行简化,即通过诱导蛋白质数据库选择尽可能少的势能项,而且这些势能项的加和可满足一定的性能要求.结果我们得出了六组势能项组合,其性能可和DGR小组得出的势能项组合相媲美,但其势能项数目却大大减少,完全可用于蛋白质结构预测.