盘羊与欧拉羊杂交后代UCP2、UCP3基因CDS区克隆与生物信息学分析

摘要

研究旨在通过对盘羊与欧拉羊杂交后代UCP2、UCP3基因CDS区克隆并进行生物信息学分析,了解其生物学特性和结构。结果表明,杂交后代羊UCP2基因CDS区长931 bp,共有7个开放阅读框,编码309个氨基酸;UCP3基因CDS区长937 bp,共有5个开放阅读框,编码244个氨基酸。杂交后代羊与绵羊的亲缘关系最为相近,与马和西伯利亚雪橇犬的亲缘关系最远。杂交后代羊UCP2理论等电点9.64,不稳定指数36.27,半衰期30 h,总平均亲水性0.109,为稳定蛋白且表现疏水性;杂交后代羊UCP3理论等电点9.25,不稳定指数44.80,半衰期30 h,总平均亲水性-0.034,为不稳定蛋白且表现亲水性。UCP2、UCP3均属于非分泌蛋白且无信号肽。UCP2、UCP3都不具有跨膜螺旋结构;UCP2存在26处磷酸化修饰位点,UCP3存在23处磷酸化修饰位点。UCP2、UCP3蛋白二级结构组成均以α-螺旋为主。同时,通过亚细胞定位发现UCP2、UCP3蛋白均主要存在于细胞质内。研究结果对今后探索UCP2、UCP3生理功能可提供一定的科学基础和依据。