纤维素降解菌Raoultella ornithinolytica LL1的筛选及基因组测序

摘要

纤维素作为一种资源丰富的天然聚合物,可被微生物降解为可溶性糖,因此筛选高效纤维素降解菌备受关注.本研究利用CMC选择培养基筛选出一株纤维素降解菌Raoultella ornithinolytica LL1,采用三代Pacbio Sequl和二代Illumina Novaseq 平台进行基因组测序,并采用DNS法测定其纤维素酶活.R.ornithinolytica LL1基因组大小为5 584 354bp,包含5 512个基因,其中NR、Swiss-Prot、Pfam、COG、GO、KEGG 和 CAZyme 数据库中分别注释有5 511、4 419、4 584、4 745、3 610、3 336和 128个基因,同时基因组注释有大量木质纤维素降解相关基因.R.ornithinolytica LL1具有较高的纤维素酶活性,其中β-葡萄糖苷酶活性最高,其次是内切葡聚糖酶,外切葡聚糖酶活性最低.本研究通过基因组测序及酶活测定揭示了R.ornithinolytica LL1降解纤维素的能力,为其降解纤维素及进一步纤维素转化奠定了基础.