番茄抗黄叶卷曲病相关基因Ty-6的克隆、序列分析及表达特性

摘要

进一步从分子水平探究番茄黄叶卷曲病,扩展其抗病基因库.通过克隆番茄黄叶卷曲病相关基因Ty-6,利用生物信息学方法对其编码蛋白一级结构、二级结构及三级结构进行序列分析,构建进化树,最后通过感染黄叶卷曲病毒,检测Ty-6基因在番茄不同时期不同组织中的表达特性.Ty-6基因共编码305个氨基酸,其编码产物属于碱性蛋白,二级结构以无规则卷曲为主,预测蛋白定位于细胞质膜上;且含有51个磷酸化位点与39个糖基化位点;启动子区主要以TATA-box为主,且含多个光响应、茉莉酸、水杨酸以及脱落酸等诱导基因表达的元件;系统发育分析结果表明其与马铃薯的亲缘关系最近;q-PCR显示在感染病毒后叶中该基因的表达量明显高于对照,且具组织表达特异性.Ty-6基因的研究不仅扩展了育种者可用的Ty基因工具包,也提供了一种抗病的可行思路.