粪便样本中高纯度人源DNA富集提取方法

摘要

粪便肠脱落细胞DNA的提取是影响基因检测技术在结直肠癌筛查领域应用的关键。目的:通过对提取过程、试剂进行研究,开发高纯度人源DNA富集提取方法。方法:对粪便样本提取前均质化方式进行优化,并使用PVP高分子交联剂预处理均质化粪便上清。结果:颠倒混匀均质化方式可以显著降低微生物DNA的比例,实现人源DNA的相对富集;PVP高分子交联剂可以有效去除多糖、蛋白、胆盐等杂质,减少粪便DNA的PCR抑制;结直肠癌患者粪便DNA与癌组织样本DNA的重亚硫酸盐转化测序(BSP)结果中的甲基化特征一致。结论:优化后的粪便DNA富集提取产物PCR检测结果准确性良好,该提取方法可行性高。