2020—2022年广西境外输入新型冠状病毒感染者流行病学和基因特征分析

摘要

目的分析广西境外输入新型冠状病毒(简称新冠病毒)感染者的流行病学和基因特征,评价境外输入病例对本土疫情的影响。方法从“中国疾控预防控制信息系统”中收集2020年3月1日—2022年12月6日广西境外输入新冠病毒感染者和聚集性疫情的相关信息,使用SPSS 20.0软件进行流行病学特征分析,用Javascript语言在Echart绘图网页绘制桑基图。使用CLC Genomics Workbench(Version 21.0.4)软件进行序列拼接,使用MEGA7.0软件构建系统进化树。结果广西共报告境外输入新冠病毒感染者4424例,其中确诊病例1023例、无症状感染者3401例。确诊病例中,以轻型(52.7%)和普通型(47.0%)为主。男女比例为6.2∶1,平均年龄37.8岁,以36~59岁为主,占比53.6%。78.3%感染者接种过疫苗。来源国主要为越南,占95.8%,入境口岸主要是凭祥友谊关(4012例,90.7%)。127起聚集性疫情累计发病6720例,其中经接触境外物品和人员引起的26起,累计发病3007例。共累计获得了241条有效的全基因组序列,聚类为44个进化分支。病原谱分析显示排在前3位的进化分支分别为BA.5.2、AY.57和BA.2。系统发育分析表明,这些境外输入新冠病毒感染者的序列与输出国(来源国)的毒株序列高度同源。结论广西持续存在输入疫情的风险,且新冠病毒易于突变,持续做好输入病毒变异监测至关重要。