基于皮肤转录组的半滑舌鳎无眼侧黑化相关基因的筛选鉴定

摘要

半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis)作为比目鱼(Pleuronectiformes)中的代表物种,是我国沿海地区重要的海水经济鱼类。半滑舌鳎体色异常的问题长期以来一直困扰着从业者。导致体色变化的原因多种多样,遗传因素是最根本原因。针对半滑舌鳎无眼侧黑化的研究多在环境、营养、生理、常见色素基因克隆等方面展开,新的功能基因挖掘工作欠缺。本研究选取半滑舌鳎不同体色皮肤进行转录组测序,通过差异基因GO和KEGG富集比对分析,在可能的6条黑色素相关的KEGG通路中筛查差异基因并对差异表达最为显著的10个基因进行了实时荧光定量聚合酶链式反应的验证。本研究找出了半滑舌鳎无眼侧黑化表达显著变化的5个功能基因,分别为txndc、alox15b、ptgs2、ptgisPTGIS、atp1a2a(p<0.05)。其中txndc、alox15b、ptgs2、ptgis基因在黑化组中表达水平高于对照组;功能方面,有3个基因均与花生四烯酸(AA)有一定的相关性,这为多不饱和脂肪酸参与半滑舌鳎体色异常的分子调控机制提供了一定的理论支持。