基于网络药理学研究赤芍防治肝癌的作用机制

摘要

目的:通过网络药理学预测赤芍防治肝癌的作用机制。方法:通过TCMSP数据库(https://tcmspw.com/tcmspsearch.php)检索赤芍的化学成分,通过STD数据库以及SEA数据库预测赤芍的作用靶点。通过OMIM数据库(http://www.omim.org/)、DrugBank数据库(https://www.drugbank.ca/)以及TTD数据库(http://db.idrblab.net/ttd/)搜集肝癌疾病相关靶点,筛选获得赤芍成分作用靶点与肝癌疾病相关靶点交集,利用String平台搜集相关靶点蛋白,借助DAVID数据库进行Gene Ontology注释分析,并通过Cytoscape 3.2.1软件构建蛋白-蛋白相互作用网络,拓扑分析得到核心靶点,进一步分析赤芍防治肝癌作用机制。结果:从中药赤芍中筛选得到28个化合物成分以及442个作用靶点,与148个肝癌相关靶点取交集得到23个共同靶点,靶点映射获得22个活性成分,蛋白-蛋白相互作用网络有193个节点,722条边,经拓扑学指标筛选得到95个节点,439条边,核心靶点有21个。GO注释得到561条生物过程,85条细胞组分以及130条分子功能的信息。结论:网络药理学直观地显示了赤芍防治肝癌具有多成分、多靶点、多通路的特点,为后续开发治疗肝癌的药物提供了理论基础。